疾控中心的前身是铜鼓县卫生防疫站，成立于1962年10月。经县编委铜编发[2003]5号文件批准，于2005年9月23日正式对外挂牌组建铜鼓县疾病预防控制中心。坐落于县城城南西路167号。2024年6月和卫生健康综合监督执法局合并。现有职工37（含编外人员5人），在职党员12人。正高级职称1人，副高级职称1人。中心承担着全县疾病预防控制、突发公共卫生事件应急处置、健康危害因素监测、公共卫生技术服务、健康教育与健康促进、科研与教学等公共卫生、卫生监督任务，内设机构8个:综合股、免疫规划股、疾控股、健康教育与健康促进股、职业健康与公共卫生监测股、卫生检验与检测股、职业健康与公共场所卫生监督股、医疗卫生与放射卫生监督股。检验设备与检验能力达到国家制定的县级疾控机构标准。隶属铜鼓县卫生健康委员会领导，业务技术接受国家、省、市疾病预防控制中心指导。